Artwork

Contenido proporcionado por Roman Cheplyaka. Todo el contenido del podcast, incluidos episodios, gráficos y descripciones de podcast, lo carga y proporciona directamente Roman Cheplyaka o su socio de plataforma de podcast. Si cree que alguien está utilizando su trabajo protegido por derechos de autor sin su permiso, puede seguir el proceso descrito aquí https://es.player.fm/legal.
Player FM : aplicación de podcast
¡Desconecta con la aplicación Player FM !

#24 Read correction and Bcool with Antoine Limasset

59:44
 
Compartir
 

Manage episode 215964325 series 1537951
Contenido proporcionado por Roman Cheplyaka. Todo el contenido del podcast, incluidos episodios, gráficos y descripciones de podcast, lo carga y proporciona directamente Roman Cheplyaka o su socio de plataforma de podcast. Si cree que alguien está utilizando su trabajo protegido por derechos de autor sin su permiso, puede seguir el proceso descrito aquí https://es.player.fm/legal.

Antoine Limasset joins me to talk about NGS read correction. Antoine and his colleagues built the read correction tool Bcool based on the de Bruijn graph, and it corrects reads far better than any of the current methods like Bloocoo, Musket, and Lighter.

We discuss why and when read correction is needed, how Bcool works, and why it performs better but slower than k-mer spectrum methods.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 episodios

Artwork
iconCompartir
 
Manage episode 215964325 series 1537951
Contenido proporcionado por Roman Cheplyaka. Todo el contenido del podcast, incluidos episodios, gráficos y descripciones de podcast, lo carga y proporciona directamente Roman Cheplyaka o su socio de plataforma de podcast. Si cree que alguien está utilizando su trabajo protegido por derechos de autor sin su permiso, puede seguir el proceso descrito aquí https://es.player.fm/legal.

Antoine Limasset joins me to talk about NGS read correction. Antoine and his colleagues built the read correction tool Bcool based on the de Bruijn graph, and it corrects reads far better than any of the current methods like Bloocoo, Musket, and Lighter.

We discuss why and when read correction is needed, how Bcool works, and why it performs better but slower than k-mer spectrum methods.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 episodios

Tất cả các tập

×
 
Loading …

Bienvenido a Player FM!

Player FM está escaneando la web en busca de podcasts de alta calidad para que los disfrutes en este momento. Es la mejor aplicación de podcast y funciona en Android, iPhone y la web. Regístrate para sincronizar suscripciones a través de dispositivos.

 

Guia de referencia rapida