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Biosíntesis. Episodio BS16

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Este episodio se grabó el 16 de julio de 2021, en el estudio de grabación de la Facultad de Ciencias de la Comunicación (Universidad de Málaga). Como siempre, os presentamos una tertulia con la actualidad de la semana en investigación biomédica. Tras la presentación, comenzamos (min. 04:00) hablando de una noticia que ha causado bastante revuelo mediático en los círculos científicos: el anuncio, por parte de dos reputadas investigadoras, la microbióloga Jill Banfield y la premio Nobel Jennifer Doudna (ambas de la Universidad de California, Berkeley), de unas misteriosas secuencias de ADN previamente desconocidas, únicas y "absolutamente fascinantes” a las que han bautizado con el rimbombante nombre de BORGs (la referencia es: Al-Shayeb et al.. Borgs are giant extrachromosomal elements with the potential to augment methane oxidation. bioRxiv 2021.07.10.451761. https://doi.org/10.1101/2021.07.10.451761). De todo este “hype” charlamos entre nosotros y con uno de nuestros mayores expertos en metagenomas (min 21:45), el profesor Francisco Rodríguez-Valera (Universidad Miguel Hernández, Elche). A continuación (min 38:30), los reporteros más dicharacheros, Belén e Íker, nos traen la sección de (bio)noticias: el impacto que ha tenido la campaña mundial de vacunación contra la COVID19 en las otras, ya establecidas, campañas anuales; la relación entre consumo de alcohol y cáncer y la publicación en Nature del código fuente de AlphaFold, un algoritmo basado en redes neuronales de predicción de estructuras tridimensionales de proteínas, creado por DeepMind (el programa de inteligencia artificial de Google) y que aspira a ser la gran revolución en Biología Estructural de este siglo (la referencia es: Jumper et al. (2021). Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold. Nature 1–11. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2). Desde luego, los primeros resultados son muy prometedores y, aunque aún requiere más entrenaniento, las espectativas son elevadas. Nuestro experto bioinformático, Francis, nos da su opinión sobre este asunto y aprovecha para comentarnos (min. 58:00) otro artículo, publicado el mismo día, pero en Science, en el que se anuncia otro algoritmo surgido, como AlphaFold, de la iniciativa CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) y que promete ser un digno competidor: RoseTTAFold (la referencia es: Baek et al. (2021). Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network. Science eabj8754. DOI: 10.1126/science.abj8754). Por último (min. 69:00), Pepe comenta un trabajo del grupo de Nuria Bigas y Lluís Espinosa (Hospital del Mar, Barcelona), recién publicado en Oncogene, en el que proponen una nueva terapia contra el melanoma basada en la combinación de un inhibidor específico del oncogén BRAF y la quimioterapia clásica. El propio Dr. Espinosa comenta con nosotros, via telefónica, los principales aspectos de este descubrimiento y sus implicaciones terapéuticas (la referencia es: Alonso-Marañón et al. (2021). Combination of chemotherapy with BRAF inhibitors results in effective eradication of malignant melanoma by preventing ATM-dependent DNA repair. Oncogene 1–7. https://doi.org/10.1038/s41388-021-01879-2). Esperamos que os guste BS16. Gracias por seguir ahí. (Audios de la misión Apolo 11, NASA: https://go.nasa.gov/3hZv5TH. Audios del Trinity nuclear test: https://bit.ly/3BxDk10)
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